作为深圳教育局直属示范性公办中学，深圳市第三高级中学构建了独特的双轨制教育体系。学校初中部扎根福田中心区文化沃土，高中部坐拥龙岗科教新城核心区位，两校区协同发展形成完备的教育生态链。
| 初中部位置 | 福田区益田村内 |
| 高中部周边 | 毗邻大运中心、香港中文大学（深圳）等高等学府 |
龙岗校区背靠城市绿肺龙城公园，前接深圳信息职业技术学院等教育机构，形成集自然生态与学术氛围于一体的育人环境。轨道交通网络覆盖全校区间，保障师生通勤便利。
通过科技创新社团、模拟联合国等特色活动，学生可参与国际基因工程机器大赛等赛事。课程设置逐步融入经济金融、跨文化沟通等前沿领域，构建知识应用场景。
香港中学文凭考试课程（DSE）作为衔接粤港澳大湾区的重要教育纽带，在语言衔接、考评方式、升学选择等方面具有独特优势。课程设置保留中华文化底蕴，同时接轨国际学术标准，形成东西方教育理念的有机融合。
| 传统课程 | DSE课程 |
|---|---|
| 单一知识传授 | 问题导向学习 |
| 标准化考核 | 多元评价体系 |
